Instrukcjami bezpieczeństwa i higieny pracy są także instrukcje medyczne BHP. W każdym zakładzie pracy powinny się znaleźć instrukcje, które opisują, jakie działania należy podjąć, jeżeli jest zagrożone życie lub zdrowie osób znajdujących się w danym przedsiębiorstwie.
Najbardziej znaną instrukcją medyczną jest instrukcja BHP udzielania pierwszej pomocy. Przykładami innych używanych w zakładach pracy instrukcjami medycznymi są: instrukcja postępowania w przypadku porażenia prądem, instrukcja ratowania i reanimowania topielców, pierwsza pomoc w nieszczęśliwych wypadkach, instrukcja obsługi apteczki pierwszej pomocy.
Zakupienie i korzystanie z tego typu instrukcji zależy od rodzaju zagrożeń dla życia lub zdrowia pracowników na terenie danego zakładu. Konieczność posiadania i stosowania instrukcji medycznych powinna być skonsultowana ze specjalistami w dziedzinie BHP.